Una piattaforma array CGH personalizzata per analizzare Variazioni del Numero di Copie in pazienti con Morbo di Parkinson
Una piattaforma array CGH personalizzata per analizzare Variazioni del Numero di Copie in pazienti con Morbo di Parkinson
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Original abstract
Il Morbo di Parkinson (MP), la seconda malattia neurodegenerativa più diffusa al mondo, è stata per lungo tempo considerata una sindrome non-genetica di origine sporadica. Numerose evidenze scientifiche oggi dimostrano che anomalie genomiche quali Variazioni del Numero di Copie (CNV nell'acronimo inglese) sono coinvolte nella patogenesi del MP e sono responsabili di specifiche forme familiari e sporadiche. A causa della variabilità nelle dimensioni delle CNV e soprattutto per via della natura quantitativa del test, la loro genotipizzazione risulta particolarmente difficile, e piattaforme innovative ad alta risoluzione e avanzati algoritmi bioinformatici stanno sempre più sostituendo i classici metodi di analisi. Nel presente studio, riportiamo la strategia di progettazione, lo sviluppo, e l'utilizzo di una piattaforma personalizzata array CGH (Comparative Genomic Hybridization), disegnata su misura per rilevare amplificazioni e delezioni in un pannello esteso di geni correlati al MP e ad altri disturbi neurologici. Tale design permette una valutazione rapida e mirata degli squilibri strutturali a livello dei geni clinicamente rilevanti per il MP, e combina le capacità di un cariotipo molecolare con una risoluzione a singolo-esone. L'utilizzo di questa piattaforma su pazienti con MP fornisce uno strumento utile per misurare CNVs chiaramente patologiche in geni noti, e permette contemporaneamente di evidenziare alterazioni strutturali in geni candidati e/o complessivamente coinvolti in funzioni nervose.